Цель. Выявление реальных биологических последствий запуска больших объемов морской воды в Куяльницкий лиман в 2014-2016 гг. Методы. Стандартные методы гидрологических, гидрохимических, гидробиологических и микробиологических исследований. Результаты. На основе проведенных комплексных исследований выполнен анализ динамики основных физико-химических и гидробиологических характеристик экосистемы Куяльницкого лимана, в первую очередь видового состава, численности и биомассы фитопланктона, бактериопланктона, зоопланктона и концентраций фотосинтетических пигментов. Показано, что исследованные биологические характеристики имеют сезонный ход, главными причинами которого являлись изменения температуры и минерализации вод лимана, а также случаи выпадения гипса, которые наблюдались летом 2015 и 2016 гг. Выводы. Запуск морской воды не дал ожидаемого результата стабильного опреснения вод лимана, но ухудшил состояние уникального биоценоза. Использование современной методологии пополнения лимана морской водой вызывает негативные последствия, которые усиливаются с каждым последующим запуском морской воды в лиман, и будут нарастать, приводя к необратимым процессам и полной деградации экосистемы лимана.